Volgens de autoriteiten ging de eerste bom af in de kerk waar op dat moment een dienst werd gehouden. Toen militairen naar het incident waren toegesneld, ontplofte nog een bom op een parkeerplaats bij de kerk. Onder de slachtoffers zijn volgens de politie twintig burgers en zeven militairen.
Wie achter de aanslag zit, is niet bekend. In het zuidwesten van de Filipijnen, waaronder op Jolo, zijn militante moslims actief. Zij strijden voor onafhankelijkheid binnen het overwegend katholieke land.